美国和墨西哥发现的病原相同，是与以往所见不同的猪流感H1N1病毒，据称混合了猪、禽、人流感病毒的基因片段。美国疾控中心证实，在墨西哥导致数十人死亡的猪流感病毒与在美国导致数十人染病的病毒都是Ａ／Ｈ１Ｎ１型，这一毒株是一种新型变异病毒，是人类流感病毒、北美洲禽流感病毒，以及北美洲、欧洲和亚洲猪流感病毒的混合体。然而，截至目前，美国患者的症状似乎较“温和”，美国尚无死亡病例报告。